Неужели дельта-вариант COVID таинственным образом исчез из Японии?


delta e1638195810515

Пятая волна японского варианта Covid-19 Delta практически исчезла настолько резко, что некоторые ученые недоумевают, почему это произошло. Одна группа ученых предполагает, что высокоинфекционный штамм Delta мутировал до исчезновения на островном государстве.

Дельта-вариант практически исчез

В середине августа в Японии наблюдался пик заболеваемости Covid-19, регистрируя более 23 000 новых случаев в день. Сейчас этот показатель составляет около 170, а количество смертей, связанных с этим заболеванием, в этом месяце в основном не превышает однозначных цифр.

Многие объясняют это снижение высоким уровнем вакцинации, общественным признанием масок и другими факторами, но некоторые исследователи утверждают, что это снижение было уникально значительным по сравнению с другими странами с аналогичными условиями.

Итуро Иноуэ, генетик из Национального института генетики, считает, что Японии посчастливилось наблюдать, как штамм Delta в основном искоренил другие варианты вируса SARS-CoV-2, а затем уничтожил сам себя. На этой неделе он объяснил теорию своей группы в газете Japan Times.

В течение некоторого времени Иноуэ и его коллеги-ученые изучали мутации SARS-CoV-2 и то, как они влияют на белок nsp14, который имеет решающее значение для размножения вируса.

РНК-вирусы, подобные тому, который вызывает Covid-19, имеют тенденцию к очень высокой скорости мутаций, что помогает им быстро адаптироваться к изменениям в окружающей среде. Однако это открывает возможности для так называемой "катастрофы ошибок", когда плохие мутации накапливаются и в конце концов приводят к полному исчезновению штамма.

Белок nsp14, по-видимому, предлагает форму коррекции ошибок, которая помогает геному вируса оставаться ниже порога "катастрофы ошибок".

Теория естественного вымирания

В случае с пятой волной Covid-19 в Японии, nsp14 дельта-варианта не справился с этой работой, считает Иноуэ, основываясь на генетическом исследовании образцов, собранных с июня по октябрь. Вопреки ожиданиям его команды, было отмечено отсутствие генетического разнообразия, в то время как многие образцы имели множество генетических изменений в участке под названием A394V, который связан с белком, исправляющим ошибки.

"Мы были буквально шокированы результатами исследования", - сказал исследователь газете Japan Times. "Дельта-вариант в Японии был высокотрансмиссивным и не пропускал другие варианты. Но по мере накопления мутаций, мы полагаем, что в конечном итоге вирус стал дефектным и не смог создавать свои копии".

Теория может иметь отношение к предыдущему штамму атипичной пневмонии, который был идентифицирован в 2003 году, объясняя, почему он не вызвал пандемии. Но подтвердить это будет трудно, поскольку вспышка закончилась относительно быстро и не привела к массовому сбору генетических данных, необходимых для проверки гипотезы.

Неясно, почему именно в Японии произошел такой удачный поворот событий, но в других странах Восточной Азии, таких как Южная Корея, где население генетически близко к населению Японии, ничего подобного не произошло. По словам Иноуэ, мутации вируса, подобные тем, которые были отмечены учеными, были обнаружены по меньшей мере в 24 странах. Он и его команда планируют опубликовать работу с подробным описанием своих выводов к концу ноября.

Даже если теория естественного вымирания подтвердится, это будет в лучшем случае временным облегчением для жителей Японии. Новые, более успешные штаммы, скорее всего, в конечном итоге попадут в страну, хотя карантинные меры и иммиграционный контроль могут задержать появление новых вариантов в Японии, считает Иноуэ.

Тем временем Токио готовится к новой волне Covid-19 этой зимой и готовится жить с этим вирусом. По сообщениям, правительство планирует ослабить ограничения на поездки, увеличив количество людей, которым разрешен въезд в страну в день, с 3500 до 5000.