Czy wariant Delta COVID w tajemniczy sposób zniknął z Japonii?


delta e1638195810515

Japońska piąta fala wariantu Delta Covid-19 praktycznie zniknęła tak dramatycznie, że niektórzy naukowcy zastanawiają się, dlaczego tak się stało. Jeden z zespołów sugeruje, że wysoce zakaźny szczep Delta zmutował na wyginięcie w tym wyspiarskim kraju.

Delta Variant praktycznie zniknęła z rynku

W połowie sierpnia, Japonia doświadczyła szczytu zakażeń Covid-19, odnotowując ponad 23 000 nowych przypadków dziennie. Teraz metryka wynosi zaledwie około 170, a zgony przypisywane chorobie w większości przypadków utrzymują się w tym miesiącu na poziomie jednocyfrowym.

Spadek ten został przypisany przez wielu wysokim wskaźnikom szczepień, społecznej akceptacji masek i innym czynnikom, ale niektórzy badacze twierdzą, że spadek był wyjątkowo znaczący w porównaniu z innymi narodami o podobnych warunkach.

Ituro Inoue, genetyk z Narodowego Instytutu Genetyki, uważa, że Japonia miała szczęście być świadkiem, jak szczep Delta w większości wykorzenił inne warianty wirusa SARS-CoV-2, a następnie sam się wyeliminował. Wyjaśnił on teorię swojego zespołu w tym tygodniu gazecie Japan Times.

Od pewnego czasu Inoue i jego koledzy naukowcy badali mutacje wirusa SARS-CoV-2 i to, jak wpływa na nie białko nsp14, które jest kluczowe dla reprodukcji wirusa.

Wirusy RNA, takie jak ten wywołujący Covid-19, mają tendencję do bardzo wysokiego tempa mutacji, co pomaga im szybko przystosować się do zmian w środowisku. Jednakże, otwiera to drzwi dla tak zwanej "katastrofy błędu", kiedy to złe mutacje piętrzą się i w końcu powodują całkowite wyginięcie szczepu.

Białko nsp14 wydaje się oferować pewną formę korekty błędów, która pomaga genomowi wirusa utrzymać się poniżej progu "katastrofy błędów".

Teoria naturalnego wymierania

W przypadku piątej fali Covid-19 w Japonii, nsp14 wariantu Delta zawiódł w tym zadaniu, uważa Inoue, opierając się na badaniach genetycznych okazów zebranych od czerwca do października. W przeciwieństwie do oczekiwań jego zespołu, brakowało różnorodności genetycznej, podczas gdy wiele próbek miało wiele zmian genetycznych w miejscu zwanym A394V, które jest związane z białkiem naprawiającym błędy.

"Byliśmy dosłownie zszokowani, gdy zobaczyliśmy wyniki badań" - powiedział badacz dziennikowi "Japan Times". "Wariant Delta w Japonii był wysoce transmisyjny i [utrzymywał] inne warianty na zewnątrz. Ale w miarę piętrzenia się mutacji, uważamy, że w końcu stał się wadliwym wirusem i nie był w stanie tworzyć kopii samego siebie."

Teoria ta mogłaby mieć znaczenie dla poprzedniego szczepu SARS, który został zidentyfikowany w 2003 roku, wyjaśniając, dlaczego nie wywołał on pandemii. Jednak trudno byłoby to potwierdzić, ponieważ epidemia zakończyła się stosunkowo szybko i nie spowodowała masowego zbierania danych genetycznych niezbędnych do przetestowania hipotezy.

Nie jest jasne, dlaczego Japonia miała ten szczęśliwy obrót wydarzeń, ale nic porównywalnego nie wydarzyło się w innych krajach Azji Wschodniej, takich jak Korea Południowa, gdzie populacje są genetycznie zbliżone do tej z Japonii. Mutacje wirusa podobne do tych oznaczonych przez naukowców zostały odkryte w co najmniej 24 krajach, powiedział Inoue. On i jego zespół planują opublikować pracę szczegółowo opisującą ich ustalenia do końca listopada.

Nawet jeśli teoria naturalnego wymierania zostanie potwierdzona, będzie to dla Japończyków co najwyżej tymczasowe uspokojenie sytuacji. Nowe, bardziej skuteczne szczepy prawdopodobnie w końcu znajdą drogę do kraju, choć środki kwarantanny i kontrola imigracji mogą opóźnić pojawienie się nowych wariantów w Japonii, uważa Inoue.

Tymczasem Tokio przygotowuje się na nową falę Covid-19 tej zimy i przygotowuje się do życia z wirusem. Rząd podobno planuje złagodzić ograniczenia w podróżowaniu poprzez zwiększenie liczby osób, którym pozwala na wjazd do kraju dziennie z 3,500 do 5,000.